Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms