Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms