Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam83bQ0VBM2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam83bQ0VBM2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam83bQ0VBM2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms