Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms