Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms