Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms