Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Siah2Q06986 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms