Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms