Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RykQ01887 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RykQ01887 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RykQ01887 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RykQ01887 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms