Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms