Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mc1rQ01727 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms