Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms