Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb2Q00977 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms