Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SeleQ00690 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SeleQ00690 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms