Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoa1Q00623 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms