Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
F8a1Q00558 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms