Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gabpb1Q00420 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Gabpb1Q00420 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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