Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cbx1P83917 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cbx1P83917 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms