Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SgcdP82347 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SgcdP82347 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SgcdP82347 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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