Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx2P81066 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irx2P81066 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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