Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad50P70388 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms