Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab3cP62823 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rab3cP62823 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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