Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lmo4P61969 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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