Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps33bP59016 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps33bP59016 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms