Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P58686 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P58686 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P58686 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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