Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Strn4P58404 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Strn4P58404 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Strn4P58404 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Strn4P58404 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Strn4P58404 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Strn4P58404 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms