Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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