Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NcanP55066 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcanP55066 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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