Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtshP49935 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtshP49935 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtshP49935 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtshP49935 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtshP49935 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtshP49935 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtshP49935 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtshP49935 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtshP49935 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms