Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms