Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab11bP46638 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms