Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms