Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syt1P46096 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syt1P46096 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syt1P46096 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syt1P46096 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms