Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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