Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms