Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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