Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptk2P34152 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms