Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TbpP29037 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TbpP29037 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TbpP29037 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms