Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms