Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa2P28309 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Defa2P28309 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms