Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde6aP27664 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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