Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd12P23812 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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