Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mdm2P23804 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mdm2P23804 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms