Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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