Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox4i1P19783 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms