Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18526 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18526 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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P18526 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18526 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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P18526 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P18526 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P18526 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P18526 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P18526 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P18526 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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P18526 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18526 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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