Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18525 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18525 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P18525 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18525 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18525 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18525 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P18525 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
P18525 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
P18525 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms