Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cxcl9P18340 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cxcl9P18340 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cxcl9P18340 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcl9P18340 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms