Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms