Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LdhbP16125 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LdhbP16125 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LdhbP16125 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms